Proyecto Argentino Interinstitucional de genómica de SARS-CoV-2
Desarrollado por el Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2.
Financiado, a tráves del subsidio FONARSEC IP COVID-19 N° 247, por la Agencia Nacional de la Promoción de la
Investigación, el Desarrollo Tecnológico y la Innovación del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación, Argentina.
Recolección
Colaboramos con Centros de Salud públicos y privados de toda Argentina para recolectar muestras biológicas de pacientes infectados
Secuenciación
Secuenciamos las muestras biológicas con equipos NGS (Next Generation Sequencing) propios, con tecnología Illumina y Oxford Nanopores
Procesamiento
Desarrollamos protocolos bioinformáticos para procesar y obtener la secuencia de las cepas circulantes en Argentina
Análisis
Con estas muestras realizamos análisis filogenéticos, filogeográficos y de asociación clínico-epidemiológicos
Integración
Con un enfoque integral, logramos obtener conclusiones de los diversos análisis realizados
Vinculación
Este conocimiento enriquece la comunidad científica y médica, y es aplicado a la sociedad en la lucha contra la pandemia de Covid-19
Objetivo del proyecto
Como objetivo general proponemos analizar la trayectoria evolutiva de las cepas del SARS-CoV-2 que circulan en Argentina para estudiar su origen y dispersión en el país, en el contexto de las cepas mundiales, como así también analizar las mutaciones que pudieran afectar el diagnóstico, la transmisión y la virulencia del virus.
Para ello realizaremos un muestreo en todo el país de aproximadamente 1000 genomas de SARS-CoV-2. Las muestras obtenidas serán secuenciadas por NGS para obtener sus secuencias genómicas, y así caracterizarlas y analizarlas desde varios enfoques.
