Constituido en el marco del Proyecto Argentino Interinstitucional de genómica de SARS-CoV-2 (PAIS)
Corresponde al grupo de investigación del Laboratorio de Virología Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez (HNRG), dirigido por la Dra. Mariana Viegas, Investigador Responsable del proyecto. Es el encargado del diseño experimental y conceptual del proyecto y de coordinación del consorcio
Equipo de trabajo: Mariana Viegas (Investigadora Responsable del proyecto); Laura Valinotto; Mercedes Nabaes; Stephanie Goya; Mónica Natale; Silvina Lusso; Dolores Acuña.
Laboratorios y Centros de Salud realizan el diagnóstico de COVID-19 y aportan las muestras de los casos positivos para ser secuenciadas. Muchos de ellos asociados a sus direcciones de epidemiología listadas a continuación de los laboratorios, que proporcionan los datos clínico-epidemiológicos. Estos laboratorios están distribuidos distintas provincias del país y la CABA:
Son los centros donde se reciben las muestras biológicas y se secuencian los genomas virales. Utilizamos secuenciadores de Illumina (MiSeq y NextSeq) y de Oxford Nanopores Technologies (MinIon).
Secuenciación Genómica: Secuenciadores Illumina NextSeq y Nanopore MinIon. Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500. Equipo de trabajo: Laura Valinotto; Mercedes Nabaes; Stephanie Goya; Mónica Natale; Silvina Lusso, Dolores Acuña; Alicia Mistchenko; Mariana Viegas.
Secuenciación Genómica: Secuenciador Illumina MiSeq y Nanopore MinIon. Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500. Equipo de trabajo: Andrea Fabiana Puebla; Andrea Verónica Peralta; Marisa Diana Farber; Ana Julia Distéfano; Marianne Graziel Muñoz Hidalgo; Norma Paniego; Mónica Fass; Viviana Cecilia Pedroarias; Mercedes Didier Garnham; Sebastián Asurmendi, Maria Inés Gismondi, María José Dus Santos, Sebastián Zunino (Htal Blas Dubarry Mercedes).
Secuenciación Genómica: Secuenciador Illumina MiSeq.
Equipo de trabajo: Santiago Ceballos, Ivan Gramundi, Cristina Nardi, Fernando Gallego.
Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinIon.
Equipo de trabajo: María Florencia Eberhardt, Cecilia Camussone, Matías Irazoqui, Ariel Amadío.
Secuenciación Genómica: Secuenciador Illumina MiSeq. Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500.
Equipo de trabajo: Melina Leonor Mazzeo, Luis Alfredo Pianciola; Ailen Fernández; María Julia Ousset; Carolina Victoria Rastellini.
Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinIon.
Equipo de trabajo: Franco Fernández, Humberto Debat, Nathalie Marquez.
Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinION. Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500.
Equipo de trabajo: Silvia Arranz; Vanina Villanova; Victoria Posner; Elizabeth Tapia; Pilar Bulacio; Joaquín Ezpeleta; Ignacio García Labari; Javier Murillo; Flavio Spetale; Laura Angelone; Agustina Cerri.
Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500.
Equipo de trabajo: Javier Sfalcin, Analía Seravalle, Clara Fay, Martina Fay, Fabián Fay.
Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinION.
Equipo de trabajo:Bettina Brusés, Laura Formichelli, Griselda Oria, Melina Lorenzini, Javier Musin y Horacio Lucero.
Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500.
Equipo de trabajo: Estefanía Tittarelli; Ariel Suárez; Edgardo Raul Streitenberger; María Verónica Masciovecchi
Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinION.
Equipo de trabajo: Fernando D. Rivero, David Di Lullo, María Amparo Assis, Bibiana Volta, Melchor Emilio Luque, Pedro Gabriel Carranza, Sergio Scrimini, Bruno Elías Luna, María Eugenia Abdala y María Belén Rivero.
Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinION.
Equipo de trabajo: María Belén Mónaco; Sebastián Gabriel Zunino; José Jaramillo Ortiz; Carla Antonella Massone.
Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinION.
Equipo de trabajo: María Silvia Ferrer, Belén Ortiz, Fernando Giuliani, Sofía Gómez, María Victoria Sanchez, Juan Pablo Mackern, Fiorella Campo Verde, Niubis Cayado, Laura Gomez.
Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500.
Equipo de trabajo: Florencia Ferrini, Guillermo Acevedo, Maria de los Ángeles Martínez, Carla Zimmerman.
Son los centros que reciben los datos generados en los centros de secuenciación, y donde se lleva a cabo un cuidadoso análisis informático para reconstruir las secuencias genómicas de SARS-CoV-2, registrar las variantes virales y detectar potenciales eventos genéticos como inserciones y deleciones nucleotídicas, entre otros.
Equipo de trabajo: Stephanie Goya.
Equipo de trabajo: Adrián Turjanski, Ezequiel Sosa, Jonathan Zaiat.
Equipo de trabajo: Maximo Rivarola, Sergio Gonzalez, Paula del Carmen Fernández, Sofia Bengoa Luoni, Diego Zavallo, Marco Cacciabue, Laura Lozano Calderón.
Equipo de trabajo: Santiago Ceballos, Ivan Gramundi.
Equipo de trabajo: Ariel Amadio, Matías Irazoqui.
Equipo de trabajo: Darío Fernández Do Porto, Florencia Castello, Federico Serral.
Equipo de trabajo: Marcelo Martí, Claudio Schuster.
Equipo de trabajo: Carolina Pintos.
Equipo de trabajo: Andrés Culasso.
Equipo de trabajo: Elizabeth Tapia.
Equipo de trabajo: Marco Cacciabue; María Inés Gismondi; CIDETIC: Gabriel Tolosa, Laboratorio de Virología Molecular, Hospital Blas L. Dubarry (Mercedes, provincia de Buenos Aires): Sebastián Gabriel Zunino; Carla Antonella Massone; José Jaramillo Ortiz.
Es el grupo que realiza los análisis evolutivos en base a las secuencias obtenidas bioinformáticamente.
Equipo de trabajo: