Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV2

Constituido en el marco del Proyecto Argentino Interinstitucional de genómica de SARS-CoV-2 (PAIS)

Composición del Consorcio

Nodo Central

Nodos de toma y procesamiento de muestras y aporte a los datos clínico-epidemiológicos

Nodos de Secuenciación genómica de muestras por NGS

Nodos de procesamiento bioinformático

Grupo de análisis de evolución molecular

Grupo de médicos epidemiólogos

Nodo Central

Corresponde al grupo de investigación del Laboratorio de Virología Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez (HNRG), dirigido por la Dra. Mariana Viegas, Investigador Responsable del proyecto. Es el encargado del diseño experimental y conceptual del proyecto y de coordinación del consorcio

Equipo de trabajo: Mariana Viegas (Investigadora Responsable del proyecto); Laura Valinotto; Mercedes Nabaes; Stephanie Goya; Mónica Natale; Silvina Lusso; Dolores Acuña.

Nodos de toma y procesamiento de muestras y aporte a los datos clínico-epidemiológicos

Laboratorios y Centros de Salud realizan el diagnóstico de COVID-19 y aportan las muestras de los casos positivos para ser secuenciadas. Muchos de ellos asociados a sus direcciones de epidemiología listadas a continuación de los laboratorios, que proporcionan los datos clínico-epidemiológicos. Estos laboratorios están distribuidos distintas provincias del país y la CABA:

Centros de salud

  1. Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Dr. Ricardo Gutiérrez (CABA): Alicia Mistchenko; Erica Grandis; María Cristina Alvarez López; María Elina Acevedo; Oscar Jacquez; Sofía Alexay; Mariángeles Barreda Fink; María Emilia Villegas; Raquel Barquez; Estela Chascón; Jorgelina Caruso; Mariana Campal; Karina Zacarías; Cristian Díaz; Oscar Luna; Cristian Turchiaro; Julián Cipelli; Guillermo Thomas; Carla Medina; Natalia Labarta; Streitenberger Cintia.
  2. Laboratorio de Inmunología y Virología Clínica; Departamento de Bioquímica Clínica;FFyB y Hospital de Clínicas "José de San Martín", Universidad de Buenos Aires (CABA): Marcelo Rodríguez Fermepin; Dra. Maria Lucia Gallo Vaulet;Analia Patricia Toledano.
  3. Instituto de Investigaciones Biomédicas en Retrovirus y Sida, CONICET-UBA (CABA): Adamczyk Alan, Alves Camila, Arruvito Lourdes, Azzolina Rolon Sabrina, Belauzarán Laura, Benencio Paula, Berardino Bruno, Berini Carolina, Biglione Mirna, Blond Oliver, Budziñski Maia, Cabrerizo Gonzalo, Cairoli Victoria, Carobene Mauricio, Cassime Silvia, Cassime Ricardo, Ceballos Ana, Cevallos Cintia Gisela, Czernikier Alejandro, Delpino María Victoria, Di Diego García Facundo, Duarte Alejandra, Ducasa Nicolás, Elía Andrés, Elizalde María Mercedes, Erdocia Mariana, Fabiano, Martina, Fava Agustina, Felder Leandro, Flichman Diego, Fontecha María Belén, Friedrich Adrián David, Fuchs Wighman Federico, Gatti Ramiro Daniel, Geffner Jorge, Ghiglione Yanina Alejandra, Giannone Denise Anabella, Girotti Romina, Giusti Sebastián, Gómez Claudio, Gonzalez Polo Virginia, Hermida Alava Katherine, Holgado María Pia, Laufer Natalia, Leicaj Luz, Longueira Yesica, Lopez Malizzia Alvaro, Manselle Cocco Montana, Mansilla María Agustina, Marin Franco Jose, Massillo Cintia, Mazzitelli Ignacio, Melucci Ganzarain Claudia, Meneghini María Agustina, Molina María Carolina, Montesano Fernando, Morando Nicolás, Ostrowski Matías, Pampuro Sandra, Paletta Ana Luz, Pando María, Pascuale Carla, Penas Federico, Pérez Paula, Piccardo Claudio, Pieralisi Azul, Pippo Mónica, Polo María Laura, Quiroga Cecilia, Quiroga Florencia, Ramirez Ezequiel, Remes Lenicov Federico, Rodriguez Jimena, Sabatté Juan, Salomón Horacio, Salvatori Melina, Sananes Inés, Santilli Cecilia, Sede Mariano, Seery Vanesa, Sierra Jessica Mariel, Sonzogni Silvina, Speroni Micaela, Trifone César, Trotta Aldana, Turk Gabriela, Varese Augusto, Vellón Luciano, Vera Aguilar Douglas, Vergara Maricef, Verneri Paula, Waisman Ariel Witteveen Camila.
  4. Hospital Alemán (CABA): Eugenia Ibañez; María Paula Della Latta; Natalia García allende.
  5. Laboratorio de Hospital El Cruce Dr. Néstor C. Kirchner, CEMET (Florencio Varela, provincia de Buenos Aires): Martin Zubieta; Marilina Rahhal, Alan Gómez, Pedro Paggi, Gastón Montecino, Tatiana Herlein y Facundo Albarenque.
  6. Unidad de Emergencia COVID-19, Plataforma de Servicios Biotecnológicos, Universidad Nacional de Quilmes (Bernal, provincia de Buenos Aires): Alejandro Castello; Hernán Farina; Sandra Goñi; Georgina Cardama; Norailys Lorenzo; Humberto Lamdan; Marcelo Mandile; Alejandra Zinni; Carla Capobianco; Gustavo Bada.
  7. Laboratorio del Hospital Interzonal General de Agudos “Evita” (Lanús; provincia de Buenos Aires): Isabel Desimone; Erica Luczak; Omar Grossi; Lorena Serrano; Rubén Pelagamos; Alejandra Musto.
  8. Laboratorio del Hospital Interzonal General de Agudos “Eva Perón” (San Martín, provincia de Buenos Aires): Claudia Kairiyama; Graciela Radczuk; Mariana Carulla; Claudia Pengue; Carolina Piñeyro; Cecilia Corigliano; Santiago Rampulla
  9. 9. Laboratorio de genética y biología molecular Hospital de trauma y emergencia Dr. Federico Abete (Malvinas Argentinas, provincia de Buenos Aires): Ivana Primost; Maria Inés Gallino
  10. Laboratorio de Virologia, HIEAyC "San Juan de Dios" (La Plata, provincia de Buenos Aires): Ercole Regina; Gatelli Andrea; Di Bella Sofia; Malaissi Luciano; Colmeiro Maria; Angeletti Andres; Martinez Agustina; Ferioli Martina.
  11. Laboratorio de salud pública, Facultad de Ciencias Exactas, UNLP (La Plata, provincia de Buenos Aires): Rosana Isabel Toro; Andrés Angelletti; Víctoria Cabassi; Victoria Nadalich; Andrés Cordero; Laura Delaplace.
  12. Hospital HIGA San Roque Gonnet (La Plata, provincia de Buenos Aires): Paula Carassi, Evelyn De la Rubia, Rosana Toro.
  13. Unidad de Diagnóstico COVID-Facultad de Ciencias Veterinarias-UNLP, provincia de Buenos Aires: Carolina Gabriela Aspitia; Nadia Analía Fuentealba; María Emilia Bravi; Carlos Javier Panei; Marco Tizzano; Gastón Andrés Moré; Magdalena Rambeaud; Javier Origlia; Gabriela Rudd; Carlos Golijow. Juan Manuel Unzaga; Marcelo Italo Pecoraro
  14. Laboratorio Vacunas Salud (VacSal) del Instituto de Biotecnología y Biología Molecular de la Facultad de Ciencias Exactas de la Universidad Nacional de La Plata-CONICET, provincia de Buenos Aires: Nicolás Ambrosis; Pablo Martin Aispuro; Keila Belhart; Daniela Bottero; Magalí Gabrielli; Alejandra Giordano; Aníbal Lodeiro; Erika Rudi; Eugenia Zurita y Daniela Hozbor.
  15. Instituto Nacional de Epidemiología "Dr. Jara" (Mar del Plata, provincia de Buenos Aires): Irene Pagano; Osvaldo Uez; Carlos Jose Cimmino.
  16. Departamento de Biología y genética molecular; IACA Laboratorios (Bahía Blanca, provincia de Buenos Aires): Estefanía Tittarelli; Ariel Suárez; Edgardo Raul Streitenberger; María Verónica Masciovecchio.
  17. Laboratorio de Biología Molecular. Hospital Dr. Héctor Cura (Olavarría, provincia de Buenos Aires): Julieta Spina; María Belén Zaffanella; Ignacia Muller, Vanesa González.
  18. Centro de Investigaciones Básicas y Aplicadas, UNNOBA (Junín, provincia de Buenos Aires): Carolina Cristina; Laura Alaniz; Virginia Pasquinelli; Laura Palumbo; InaSevic; Rodrigo Hernández del Pin; Fiorella Spinelli; Gianina Demarchi; Daiana Vitale; Antonella Icardi; Chiara Cassarini; Paolo Rosales; Sofia Perrone; Nadia Bonadeo; Sofia Valla; Agustina Chimento; Alejandro Moroni; Micaela Castro; Alejandra Fernández; Angela Barbero; Laureano Español; Lorenzo Morro; atalia Menite; Gastón Villafañe; Lucía Romano; María Gracia Balbi; Alejandra Brandone y Natalí Bagnis.
  19. Laboratorio del Hospital Zonal Especializado Materno Infantil “Argentina Diego” de Azul, provincia de Buenos Aires: Guillermina; María Belén Arpaia; Farinella Bagnozzi y Santiago Hernán Gauna.
  20. Laboratorio de Virología de la Facultad de Veterinaria de la Universidad Nacional del Centro de la provincia de Buenos Aires (UNCPBA) (Tandil, provincia de Buenos Aires): Guillermina Dolcini; Sandra Perez; Victoria Nieto Farias, Carolina Ceriani.
  21. Laboratorio Central de Neuquén, Ministerio de Salud (Neuquén, provincia de Neuquén): Luis Pianciola; Melina Mazzeo; Beatriz Carolina Pinto; María Cecilia Ziehm, Ailen Fernandez, J Ousset, C Rastellini,
  22. Laboratorio Central Sección Virología. Hospital Regional Artemides Zatti (Viedma; provincia de Rio Negro): Darío Fabián di Prátula; Antonela De Fino
  23. Laboratorio MICROBIOM (General Roca; provincia de Río Negro): Silvana Cecchi.
  24. Hospital Zonal Dr. Ramón Carrillo (San Carlos De Bariloche; provincia de Río Negro): María Laura Álvarez; Yesica Espasandin; Patricia Valeria Blanco.
  25. Hospital zonal Francisco Lopez Lima (General Roca, provincia de Río Negro): Juan Laher, Daniela Durany, Teresa Paniceres, Andrea Montecinos.
  26. Laboratorio de Patologías Prevalentes y Epidemiología del Hospital de Trelew (Trelew, provincia de Chubut): Diana Berry.
  27. Laboratorio de Salud Pública de Tierra del Fuego y Laboratorio de Hospital Regional (Ushuaia; provincia de Tierra del Fuego): Ivan Gramundi; Manuel M Boutureira; Gabriel A. Castro; Carina De Roccis.
  28. Laboratorio de la Dirección de Epidemiología (Santa Rosa, provincia de La Pampa): Claudia Rechimont, José Carlos Usero, Matías Villasana, María de los Ángeles Irastorza.
  29. Laboratorio Central (Santa Fe; provincia de Santa Fe): Carlos Pastor; Guillermo Ojeda; Gabriela Rompato; Viviana Mugna.
  30. Laboratorio del Hospital "Jaime Ferré" SAMCO Rafaela (provincia de Santa Fe): Verónica Pandolfi, Juan Franco Quaranta, Cristina Isaías.
  31. CIBIC Laboratorio (Rosario, provincia de Santa Fe): Javier Sfalcin, Analía Seravalle, Clara Fay, Martina Fay, Mariana Galizzi, Fabián Fay.
  32. Centro de Tecnología en Salud Pública; Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas (UNR), provincia de Santa Fe. Responsables: Ana Laura Cavatorta; Julián Acosta, Eduardo Codino.
  33. Laboratorio de Biología Molecular; Hospital-Escuela “Eva Perón”, Rosario, provincia de Santa Fe: Pamela Cribb; Esteban Serra, Juan Rossi; Eduardo Gregorini
  34. Hospital Provincial del Centenario (Rosario, provincia de Santa Fe): María Belén Martí, Lucía Moriena, Alejandra Asueta, Laureana Villarreal, Ailén Ponzi, Camila Bogado, Lucía Porfiri, Paula Díaz Viñuela, Florencia Dassie, Milca Bordón, Mauro Balseiro. IDICER-CONICET-UNR: Spinelli Silvana.
  35. Laboratorio Central, Ministerio de Salud (Córdoba, provincia de Córdoba): Gabriela Barbas; Gonzalo Castro.Instituto de Virología “Dr.J.M.Vanella” Facultad de Ciencias Médicas, Universidad Nacional de Córdoba (provincia de Córdoba): Viviana Ré, María Belen Pisano.
  36. Servicio de Inmunología del Hospital Perrando e Instituto de Medicina Regional de la UNNE (Resistencia, provincia de Chaco): María Delia Foussal; Gerardo Deluca; Gustavo Giusiano; Horacio Lucero y Marcelo Marin.
  37. Laboratorio Central de Salud Pública de Provincia de Chaco (Resistencia, provincia de Chaco): Natalia Andrea Ayala y María Verónica Gómez, Erica Struss, Esteban Paredes.
  38. Hospital Pediátrico Dr. Avelino Castelan (Resistencia, provincia de Chaco): Marino Goia, Lopez María Cecilia, Gili Andrea.
  39. Servicio de Microbiología, Hospital 4 de Junio (Presidencia Roque Saenz Peña, provincia de Chaco): Andrea Carolina Piedrabuena, Mendoza Mayra y Jurasek Gabriela.
  40. Laboratorio Central De Redes y Programas (Ministerio de Salud, Corrientes, provincia de Corrientes): Natalia Ruiz Diaz; Gerardo Andino, Silvina Martínez, Susana Soto, José Espinoza, Martín Coceres.
  41. Laboratorio de Salud Pública (San Miguel de Tucumán, provincia de Tucumán): Ana Maria Zamora, Gustavo Ruíz de Huidobro, Dardo E. Costas, Graciela Alabarse.
  42. Laboratorio Central de Salud Pública (San Salvador de Jujuy, provincia de Jujuy): Miguel Alejandro Charre; Ariel David Fridman; Claudia Mamani; Fabiana Vaca.
  43. Laboratorio de Virus Respiratorios y Neurovirosis. Hospital Señor del Milagro (Salta capital, provincia de Salta): Raskovsky Viviana, Lavaque Esteban, Veronica Lesser, Pamela Cajal, Fernanda Aguero.
  44. Laboratorio de Virología Molecular, Hospital Blas L. Dubarry (Mercedes, provincia de Buenos Aires): María Belén Mónaco; Sebastián Gabriel Zunino; José Jaramillo Ortiz; Carla Antonella Massone; Leandro García; Flavia Noelia Minutto; Gabriela Elena Zunino; Belén Ubaldo; Elizabeth Joyce Maleplate; Anna Belén Calloni.
  45. Laboratorio de Diagnóstico de la UNAHUR (Universidad de Hurlingham, Hurlingham, provincia de Buenos Aires): María José Dus Santos, Marina Mozgovoj, Marcela Pilloff, Adriana Fernández Souto, Pablo Raies, Valeria Marsal, Juan Manuel Velazquez, Daiana Sofia Blanc, Mercedes Didier Garnham, Germán Albornoz, Agustín Lara, Martín Lemos Vilches, Natalia Caleni.
  46. Laboratorio de Biología Molecular UFU y Epidemiología Hospital Pedro de Elizalde, (CABA): Javier Indart, Jaqueline Rocovich, Maria Jose Rial, Luciana Montoto Piazza, Gretel Wenk, Ricardo Del Olmo, Vivian Bokser, Laura Miño, Eugenia Sevilla, Paulina Marchetti, Franco Morandi, Maria Laura Sueiro, Aldana Claps, Federico Lorenzo, Rocío Romero, Julián Chamorro, Julieta Gondolessi, Belén Carolina Diaz, Daiana Rosales, Florencia Alegre, Natalia Zamora, Alejo Fernandez, Jimena Castedo, Eugenia Paez, Ruth Galarza, Jaqueline Ramirez   
  47. Laboratorio del HOSPITAL CENTRAL (Ciudad de Mendoza, provincia de Mendoza): María Liliana Videla, Luciano Lima, Andrea Naser, Pablo Rico, Valeria Fontana, Héctor Horacio Cuello.
  48. Laboratorio del HOSPITAL NOTTI (Ciudad de Mendoza, provincia de Mendoza): Sandra Grucci, Vanina Eibar, Noelia Cuglia, Adriana Recabarren, Daiana Lang, Clara Pott Godoy.
  49. LABORATORIO DE SALUD PUBLICA (Ciudad de Mendoza, provincia de Mendoza): Viviana Leiva, Silvia Zerrer, Belén Ortiz, Silvina Denita, Luciana Martinez, Cristian Garay, Fernando Giuliani.
  50. Sección Biología Molecular, Laboratorio Hospital Schestakow (San Rafael, provincia de Mendoza): Cecilia Capone, Adrián Lucero, Federico Oviedo, Noelia Lucero
  51. Laboratorio de Biología Molecular, Hospital Cosme Argerich (CABA): Marcia Pozzati, Jésica Galeano, Florencia Rodríguez, Florencia Funez, Andrea Fernández, Karina Polanski.
  52. Laboratorio del Hospital Teresa Germani Laferrere (La Matanza, provincia de Buenos Aires): Anabel Luzio, Gisela Sauco, Mauricio Spacaventto
  53. Programa Laboratorio de Salud Pública "Dr Dalmiro Pérez Laborda" (Ministerio de Salud de la provincia de San Luis): Juan Manuel Talia, María Agustina Lacaze, Jorge Bohn, Blanca Hebe Esteves, Eliana Maria Rosales, Juan Pablo Perez Diaz, Matias Perez Diaz, Francisco Jofré, Florencia Cabral Bombardieri, Julieta Peñalva, Gustavo Rivero, Marcelo Olivera, Leonardo Aguilera, Anna Chiara Mastrodonato, Luciana Molina, Dra. Ludmila Campos, Federico Quijano, Erica Carrizo
  54. Laboratorio de biología molecular del Hospital Centenario (Gualeguaychú, provincia de Entre Ríos): Gustavo Levin, Débora Kesselman, Paulina Melchiori, Leticia Siri, Ignacio Bourlot.
  55. Laboratorio de Biología Molecular Bolívar (LABBO) (provincia de Buenos Aires): María Estela Jofré, María Roció Larreche, Marina Ticeira, Fiorella Di Claudio, Romina Cabrerizo, María Laura Caviglia, María de los Ángeles D’Andrea, Felisa Lescano, Micaela Martínez
  56. Laboratorio de Biología molecular del Hospital General de Agudos Dr. Carlos G. Durand (CABA): Clara Theaux, Guillermo Notaristéfano, María Belén Rodríguez Cardozo, Constanza Marina, Noelia Anzorena, Estela Dima, Cecilia Irrazábal, Lucas Dahinten, Camila Elsegood, Silvia Matillas, Natasha Frisone, Albano Costa, Nuria Cañellas Walter Loayza, Martín Rodríguez Saá, Natalia Chiussi, Noelia Narduzzi, Anisa Marchissio, Belen Warszatska, Ailin Domínguez, Maricel Leivas, Maryury Colina, Adriana Rozo, Laura Jurado, María Fernanda Yaunguzian, Romina Gatica, Flavia Rivarola, Rocío Carrón, Yesica Castro. Promoción y Protección de la Salud: Miriam Bruno, Eugenia Langan, Laura Álvarez
  57. Laboratorio de Virología del Hospital JJ Urquiza (Concepción del Uruguay, provincia de Entre Ríos): Manuel Arca, Agustina Bonnet, Florencia Rojas, Marlene Giraldes, Alejandra Lezica, Florencia Rojas, Jessica Carrocino, Luis Fick, Magalí Rolleri, Betiana Paucar, Florencia Garelli, Sabrina Cerutti, Fernando Gadea, Facundo Punzi, Francisco Arca, Anabella Gimenez, Florencia Rodríguez.
  58. Centro Provincial de Referencia VIH/SIDA y Hepatitis Virales – Instituto Biológico Dr Tomás Perón (La Plata, provincia de Buenos Aires): Aldana Gatti; Aldana Nardone; Carolina Talavera; Camila Real; María Eugenia Suarez; Felipe Szymanowski; Francisco Nogueira Laspuir; Karen Nicole Fresina; Lucrecia Carlos; Magali Sanchez; Maria Valle; Matías Romanko; Rosario Dehaut; Samanta Ten Huver; Daniela Sanchez; Silvia González; Sol Pagliari; Susana Gimenez; Valeria Gutierrez; Vanina Dolcini; Marisa Corazza.
  59. Laboratorio de Alta Complejidad (LACMI), Instituto de Genética Humana (IGeHM), Parque de la Salud de la provincia de Misiones, Universidad Nacional de Misiones (UNaM): Karina Salvatierra, Carmen Gonzales, Tania A. Benitez, Daiana Urquiza, Mara Vogel, Carina Ludojoski, Gaston Silva, Ronald Fontana, Cecilia Aguirre y Marcelo Gamarra
  60. Centro Especializado de Análisis Moleculares y Metabólicos, Ministerio de Salud de Santiago del Estero, provincia de Santiago del Estero: Marcelo Ariel del Valle Ovejero, Valeria Ledesma Piga, Carime Karam, Daniel Adrián Herrera, Rodrigo Gramajo, Pablo Santiago Yute, María Florencia Coronel y María Lorena Méndez.

Nodos de Secuenciación genómica de muestras por NGS

Son los centros donde se reciben las muestras biológicas y se secuencian los genomas virales. Utilizamos secuenciadores de Illumina (MiSeq y NextSeq) y de Oxford Nanopores Technologies (MinIon).

NODO A: Laboratorio de Virología HNRG (CABA)

Secuenciación Genómica: Secuenciadores Illumina NextSeq y Nanopore MinIon. Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500.
Equipo de trabajo: Laura Valinotto; Mercedes Nabaes; Stephanie Goya; Mónica Natale; Silvina Lusso, Dolores Acuña; Alicia Mistchenko; Mariana Viegas.

NODO C: IABIMO-INTA Castelar (Provincia de Buenos Aires)

Secuenciación Genómica: Secuenciador Illumina MiSeq y Nanopore MinIon. Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500.
Equipo de trabajo: Andrea Fabiana Puebla; Andrea Verónica Peralta; Marisa Diana Farber; Ana Julia Distéfano; Marianne Graziel Muñoz Hidalgo; Norma Paniego; Mónica Fass; Viviana Cecilia Pedroarias; Mercedes Didier Garnham; Sebastián Asurmendi, Maria Inés Gismondi, María José Dus Santos, Sebastián Zunino (Htal Blas Dubarry Mercedes).

NODO D: HRU, UNTDF y CADIC-CONICET (Provincia de Tierra del Fuego)

Secuenciación Genómica: Secuenciador Illumina MiSeq.
Equipo de trabajo: Santiago Ceballos, Ivan Gramundi, Cristina Nardi, Fernando Gallego.

NODO E: EEA Rafaela-INTA-CONICET (Provincia de Santa Fe)

Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinIon.
Equipo de trabajo: María Florencia Eberhardt, Cecilia Camussone, Matías Irazoqui, Ariel Amadío.

NODO F: Laboratorio Central de Neuquén (Ministerio de Salud) (Provincia de Neuquén)

Secuenciación Genómica: Secuenciador Illumina MiSeq. Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500.
Equipo de trabajo: Melina Leonor Mazzeo, Luis Alfredo Pianciola; Ailen Fernández; María Julia Ousset; Carolina Victoria Rastellini.

NODO G: IPAVE-CIAP-INTA (Provincia de Córdoba)

Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinIon.
Equipo de trabajo: Franco Fernández, Humberto Debat, Nathalie Marquez.

NODO H: Laboratorio Mixto de Biotecnología Acuática (LMBA), Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas (UNR) y Secretaría de Ciencia, Tecnología e Innovación de Santa Fe.

Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinION. Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500.
Equipo de trabajo: Silvia Arranz; Vanina Villanova; Victoria Posner; Elizabeth Tapia; Pilar Bulacio; Joaquín Ezpeleta; Ignacio García Labari; Javier Murillo; Flavio Spetale; Laura Angelone; Agustina Cerri.

NODO I: CIBIC Rosario, Santa Fe.

Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500.
Equipo de trabajo: Javier Sfalcin, Analía Seravalle, Clara Fay, Martina Fay, Fabián Fay.

NODO J: IMR (Instituto de Medicina Regional) de Resistencia, provincia de Chaco.

Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinION.
Equipo de trabajo:Bettina Brusés, Laura Formichelli, Griselda Oria, Melina Lorenzini, Javier Musin y Horacio Lucero.

NODO K: IACA Bahía Blanca, PBA.

Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500.
Equipo de trabajo: Estefanía Tittarelli; Ariel Suárez; Edgardo Raul Streitenberger; María Verónica Masciovecchi

NODO L: Laboratorio de Biología Molecular, Inmunología y Microbiología (LaBIM), Facultad de Ciencias Médicas, Instituto Multidisciplinario de Salud Tecnología y Desarrollo (IMSaTeD, CONICET-UNSE), Santiago del Estero.

Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinION.
Equipo de trabajo: Fernando D. Rivero, David Di Lullo, María Amparo Assis, Bibiana Volta, Melchor Emilio Luque, Pedro Gabriel Carranza, Sergio Scrimini, Bruno Elías Luna, María Eugenia Abdala y María Belén Rivero.

NODO M: Laboratorio de Virología Molecular, Hospital Blas L. Dubarry (Mercedes, provincia de Buenos Aires).

Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinION.
Equipo de trabajo: María Belén Mónaco; Sebastián Gabriel Zunino; José Jaramillo Ortiz; Carla Antonella Massone.

NODO N: Laboratorio de Salud Pública e Instituto de Medicina y Biología Experimental de Cuyo (IMBECU) ciudad de Mendoza, provincia de Mendoza.

Secuenciación Genómica: Secuenciador Nanopore MinION.
Equipo de trabajo: María Silvia Ferrer, Belén Ortiz, Fernando Giuliani, Sofía Gómez, María Victoria Sanchez, Juan Pablo Mackern, Fiorella Campo Verde, Niubis Cayado, Laura Gomez.

NODO O: Laboratorio de Medicina Genómica, Facultad de Medicina - UNNE (Corrientes, provincia de Corrientes).

Vigilancia de Variantes: Secuenciador ABI3500.
Equipo de trabajo: Florencia Ferrini, Guillermo Acevedo, Maria de los Ángeles Martínez, Carla Zimmerman.

Nodos de procesamiento bioinformático

Son los centros que reciben los datos generados en los centros de secuenciación, y donde se lleva a cabo un cuidadoso análisis informático para reconstruir las secuencias genómicas de SARS-CoV-2, registrar las variantes virales y detectar potenciales eventos genéticos como inserciones y deleciones nucleotídicas, entre otros.

Nodo coordinador: Laboratorio de Virología HNRG (CABA)

Equipo de trabajo: Stephanie Goya.

IQUIBICEN e IC - CONICET y Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA)

Equipo de trabajo: Adrián Turjanski, Ezequiel Sosa, Jonathan Zaiat.

IABIMO-CICVyA-INTA-CONICET (Provincia de Buenos Aires)

Equipo de trabajo: Maximo Rivarola, Sergio Gonzalez, Paula del Carmen Fernández, Sofia Bengoa Luoni, Diego Zavallo, Marco Cacciabue, Laura Lozano Calderón.

HRU, UNTDF y CADIC-CONICET (Provincia de Tierra del Fuego)

Equipo de trabajo: Santiago Ceballos, Ivan Gramundi.

EEA Rafaela-INTA-CONICET (Provincia de Santa Fe)

Equipo de trabajo: Ariel Amadio, Matías Irazoqui.

Instituto de Cálculo - CONICET y Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA)

Equipo de trabajo: Darío Fernández Do Porto, Florencia Castello, Federico Serral.

IQUIBICEN - CONICET y Facultad de Ciencias Exactas y Naturales (UBA) - Grupo Marcelo Martí

Equipo de trabajo: Marcelo Martí, Claudio Schuster.

Laboratorio Central de Neuquén (Ministerio de Salud) (Provincia de Neuquén)

Equipo de trabajo: Carolina Pintos.

Cátedra de Virología de Facultad de Farmacia y Bioquímica-UBA (CABA)

Equipo de trabajo: Andrés Culasso.

CIFASIS-CONICET/UNR y Facultad de Ciencias Exactas, Ingeniería y Agrimensura, UNR

Equipo de trabajo: Elizabeth Tapia.

Universidad Nacional de Luján (Provincia de Buenos Aires): Departamento de Ciencias Básicas

Equipo de trabajo: Marco Cacciabue; María Inés Gismondi; CIDETIC: Gabriel Tolosa, Laboratorio de Virología Molecular, Hospital Blas L. Dubarry (Mercedes, provincia de Buenos Aires): Sebastián Gabriel Zunino; Carla Antonella Massone; José Jaramillo Ortiz.

Grupo de análisis de evolución molecular

Es el grupo que realiza los análisis evolutivos en base a las secuencias obtenidas bioinformáticamente.

Evolución molecular

Equipo de trabajo:

  • Nodo Coordinador de Evolución: Carolina Torres, Laura Mojsiejczuk, Guido Konig, Paula Aulicino, Mariana Viegas.
  • Laboratorio de Virología, Hospital de Niños Ricardo Gutiérrez (CABA): Mariana Viegas, Stephanie Goya, Mercedes Nabaes.
  • Cátedra de Virología de Facultad de Farmacia y Bioquímica-UBA (CABA): Carolina Torres, Andrés Culasso, Laura Mojsiejczuk, María Dolores Blanco Fernandez, Débora Marcone, Viviana Mbayed, Rodolfo Campos, Lucia Vicenta Cavallaro.
  • Laboratorio de Biología Celular y Retrovirus, UVEM. Hospital Garrahan (CABA): Paula Aulicino.
  • IABIMO-CICVyA-INTA-CONICET Evolución (CABA): Guido König, Laura Lozano Calderón.
  • FCEN-UBA / IQUIBICEN CONICET (CABA): Darío Do Porto, Claudio Schuster.
  • HRU, UNTDF y CADIC-CONICET (Provincia de Tierra del Fuego): Santiago Ceballos, Iván Gramundi.
  • Laboratorio Central de Neuquén (Ministerio de Salud) (Provincia de Neuquén): Carolina Pintos
  • IPAVE-CIAP-INTA (Provincia de Córdoba): Humberto Debat.
  • IBR-CONICET/UNR y Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas, UNR: Adriana Giri.
  • Universidad Nacional de Luján, Departamento de Ciencias Básicas (Provincia de Buenos Aires): María Inés Gismondi, Juan Kelly.

Grupo de médicos epidemiólogos

Aporte a los análisis epidemiológicos:

  • Grupo colaborativo del Ministerio de Salud de la Provincia de Buenos Aires: Marina Pifano y Enio García (gabinete de asesores de ministro); Laura Fischerman y Lorena Pérez (Dirección de Vigilancia Epidemiológica y Control de Brotes).
  • Gerencia Operativa de Epidemiología, Ciudad de Buenos Aires: Mónica Valenzuela.
  • Laboratorio Central de Neuquén (Ministerio de Salud): María Cecilia Ziehm
  • Dirección epidemiología Rio Negro: Liliana Fonseca, Marcela Nóbile.
  • Dirección epidemiología La Pampa: Ana Gabriela Bertone.
  • Dirección de epidemiología Chaco: Antonieta Cayré, Laura Lescano.
  • Dirección de epidemiología Mendoza: Andrea Falaschi, Aguirre Carolina, Erica Negri, Bosio Lia, Patricia Robledo, María Belén Peralta Roca. Coordinador Red de Laboratorios del Ministerio de Salud de la provincia de Mendoza: Carlos Espul
  • Dirección de epidemiología Chubut: Teresa Estrella
  • Dirección de epidemiología de Chaco: María Antonieta Cayre, María Laura Lescano.
  • Dirección de epidemiología de Santiago del Estero: María Florencia Coronel, María Lorena Méndez