Análisis filodinamico desde la base de datos mundial de SARS-CoV-2 GISAID

17 de marzo de 2021

Distribución de linajes en Argentina

16 de julio de 2020

Analizamos la distribución de linajes en Argentina, en base a las 83 secuencias genómicas de las muestras del presente proyecto, obtenidas de diversas regiones de Argentina durante Marzo y Abril del 2020.

¿Que sucede en nuestra región?

1 de julio de 2020

En Argentina actualmente existen 29 secuencias de SARS-CoV-2. Generamos un árbol filogenético a partir del alineamiento múltiple de 375 secuencias aisladas de pacientes de países de latinoamérica, incluyendo las secuencias argentinas.

Búsqueda de posibles compuestos contra SARS-CoV-2

3 de julio de 2020

A partir de las proteínas anotadas de SARS-CoV-2, disponibles en UniProt, se buscaron los dominios funcionales a través de HMMER utilizando como base de datos de referencia PFAM-A (Base de datos de dominios).

Protocolo de secuenciación con equipos Illumina

Protocolo de procesamiento bioinformático (Illumina)

Protocolo de procesamiento bioinformático de muestras secuenciadas con equipos Illumina.