Analizamos la distribución de linajes en Argentina, en base a las 383 secuencias genómicas de las muestras del presente proyecto, obtenidas de diversas regiones de Argentina durante Marzo y Abril del 2020. El resultado se muestra en el siguiente panel, el cual permite visualizar y explorar tanto árboles filogenéticos como linajes geográficos (mapa) y temporales (línea de tiempo).

Para la asignación de linajes se utilizaron los programas Pangolin COVID-19 Lineage Assigner y Covidex. Ambas herramientas permiten determinar el linaje, la primera a través una asignación filogenética usando secuencias de referencia, y la segunda a través de la identificación de patrones complejos mediante machine learning.

Posteriormente el Nodo de Evolución del Consorcio realizó los análisis filogenéticos necesarios para poder confirmar los linajes inicialmente asignados a las secuencias. En general, hubo correlación entre los resultados de los dos programas de asignación de linajes rápidos y la obtenida por métodos filogenéticos.