PAIS supera su meta inicial: más de 1000 genomas virales secuenciados

30/03/2021

En Proyecto PAIS hemos secuenciado y caracterizado más de 1000 genomas virales de SARS-CoV-2 desde el inicio de la pandemia a la fecha. Además, con la estrategia de vigilancia de variantes, hemos logrado obtener más 890 secuencias parciales de spike. Todas estas secuencias, tanto las completas como las parciales, se encuentran publicadas en la base de datos de referencia mundial GISAID.

Gracias al esfuerzo de todos los involucrados, seguiremos en este camino con el objetivo de continuar realizando la caracterización genómica y la vigilancia epidemiológica de variantes a lo largo y ancho de Argentina.

Proyecto Argentino Interinstitucional de genómica de SARS-CoV-2

Desarrollado por el Consorcio Argentino de Genómica de SARS-CoV-2.
Financiado, a tráves del subsidio FONARSEC IP COVID-19 N° 247, por la Agencia Nacional de la Promoción de la
Investigación, el Desarrollo Tecnológico y la Innovación del Ministerio de Ciencia, Tecnología e Innovación, Argentina.

Reportes Proyecto Genómica

Recolección

Colaboramos con Centros de Salud públicos y privados de toda Argentina para recolectar muestras biológicas de pacientes infectados

Secuenciación

Secuenciamos las muestras biológicas con equipos NGS (Next Generation Sequencing) propios, con tecnología Illumina y Oxford Nanopores

Procesamiento

Desarrollamos protocolos bioinformáticos para procesar y obtener la secuencia de las cepas circulantes en Argentina

Análisis

Con estas muestras realizamos análisis filogenéticos, filogeográficos y de asociación clínico-epidemiológicos

Integración

Con un enfoque integral, logramos obtener conclusiones de los diversos análisis realizados

Vinculación

Este conocimiento enriquece la comunidad científica y médica, y es aplicado a la sociedad en la lucha contra la pandemia de Covid-19

Objetivo del proyecto

Como objetivo general proponemos analizar la trayectoria evolutiva de las cepas del SARS-CoV-2 que circulan en Argentina para estudiar su origen y dispersión en el país, en el contexto de las cepas mundiales, como así también analizar las mutaciones que pudieran afectar el diagnóstico, la transmisión y la virulencia del virus.
Para ello realizaremos un muestreo en todo el país de aproximadamente 1000 genomas de SARS-CoV-2. Las muestras obtenidas serán secuenciadas por NGS para obtener sus secuencias genómicas, y así caracterizarlas y analizarlas desde varios enfoques.

muestras de todo el país ya fueron secuenciadas
investigadores y profesionales de la salud involucrados
protocolos de investigación desarrollados
instituciones públicas y privadas participantes